支原体感染导致的肺炎不是真菌感染，支原体和真菌是两种不同病原体。
支原体肺炎由肺炎支原体感染所致肺间质病变，主要以发热、咳嗽为主。诊断依据主要是血清特异性抗体检测，其抗体滴度呈4倍或4倍以上增高或减低时可以确诊，治疗主要以大环内酯类抗生素，如阿奇霉素、红霉素等。
肺部真菌感染分原发性和继发性，好发人群为是免疫缺陷、长期使用免疫抑制剂、长期使用抗生素患者等。主要的治疗药物为抗真菌药物，如氟康唑、伊曲康唑、伏立康唑等。两者是完全不同的肺炎，治疗方法也是完全不同的。