患者出现生殖器肿大时，其病因需要结合患者的具体病情，综合分析后判断。如果患者生殖器肿大的同时，伴有皮肤红肿及明显的疼痛症状，则是由于生殖器感染所引起的。
这时需要予以静脉滴注抗生素积极抗炎治疗，同时予以莫匹罗星软膏等药物，涂抹患处消炎治疗。如果在过度激烈的性交后出现生殖器肿大，则考虑有生殖器外伤的可能，可暂时不予以特殊治疗。但不能接触性刺激而导致阴茎勃起，更不能进行性生活。
除上述原因以外，发生生殖器恶性肿瘤时，也会出现生殖器肿大。此时可触及质地坚硬的肿块，且边界不清晰，需限期行肿瘤根治手术治疗。