先天性的直肠狭窄可以通过直肠扩张或者手术治疗。
先天性的直肠狭窄其形成的原因是先天发育不良，导致肠腔变窄，粪便排出受到阻碍，引起排便困难，导致便秘。一旦发生先天性的直肠狭窄，首先要注意观察患儿的排便情况，如果患儿能排出粪便，没有形成完全的梗阻，可以采取直肠扩张治疗。需要做6~10个月的扩肛治疗，再观察排便情况，如果恢复正常可以不考虑手术治疗。
如果比较严重的先天性直肠狭窄，患儿排便困难，形成了完全的肠梗阻。这种情况需要及时手术治疗，术后做好伤口的护理，促进排便通畅。