在患上咽峡炎之后，如果需要使用药物治疗，通常临床上常用到的药物，主要包括抗病毒药物、抗生素药物以及解热镇痛类的药物。
首先，咽峡炎可能是由于疱疹病毒感染引发。病毒感染后，可以使用抗病毒药物进行治疗，有助于缩短病程、改善临床症状的严重程度、提高患者咽峡部位的舒适度。
其次，咽峡炎患者多数会伴随身体的发热等表现，解热镇痛类药物可以降低身体的温度。部分患者还可能会继发细菌感染，抗生素药物有助于消除此类感染。