眼科常用的眼药水有抗生素眼药水、糖皮质激素类眼药水，还有一些特殊的药物，作用于瞳孔的药物，降眼压眼药水、抗过敏眼药水、麻醉剂、生物制剂和检查诊断用药等。
抗生素眼药水主要是抗细菌、病毒、真菌、衣原体等致病微生物。包括妥布霉素、庆大霉素滴眼液、氯霉素滴眼液、林可霉素滴眼液、氧氟沙星滴眼液、左氧氟沙星滴眼液等等。
抗真菌的有两性霉素b、那他霉素滴眼液，抗病毒的有阿昔洛韦滴眼液等等。抗炎药物包括激素类、非甾体类、抗组胺药以及肥大细胞稳定剂。