益生元喝了拉肚子主要是由于肠道环境和敏感度不同造成的。
不管是直补活菌或者是益生元的改善效果，也或者是两种产品一起服用后，突然大量增加的有益菌群都会比较活跃，加上个体差异，肠道的蠕动加快，大便的湿度、水分也会随着大量的有益菌群产生的维生素或短链脂肪酸而增加。
很多人会出现类似拉肚子，但不是腹泻的情况。通过减量或者停用观察，不适感几天后就会逐渐消失，待适应之后按正常用量服用即可。