眼睛黑色素沉淀一般不需要特殊治疗，应密切观察。
眼球表面黑色素沉着，常见于巩膜黑变以及结膜色素痣。巩膜黑变病患者常没有明显症状，也无视力下降，仅表现为巩膜不规则青灰色斑块。这种情况不用特殊处理，但需密切观察病情。若发现黑色素突出增多、体积增大，并且色素逐渐隆起或形成结节，甚至伴有破溃、出血等症状时，应该立即到医院就诊，必要时取活检进行检查。
巩膜黑色素变一般不恶变，但结膜色素痣有可能恶变，形成黑色素瘤。