心脏介入和神经介入的不同点主要是适应证，以及部分器械使用不同。
一方面，适应证不同，心脏介入的适应证非常广泛，大部分心脏疾病都可以通过心脏介入来诊断和治疗。常见的有冠心病支架植入治疗，以及球囊扩张成形术治疗，先天性心脏病介入封堵治疗。此外，心律失常的永久起搏器植入治疗以及射频消融治疗，心肌病的心脏再同步化治疗等。而神经介入治疗主要的适应证是颈动脉狭窄，以及脑梗塞或者脑出血等方面的疾病。
另一方面，器械使用不同，心脏介入的使用器械种类非常多，比如有支架、起搏器、射频消融导管、封堵伞等等。而神经介入主要的器械主要是弹簧圈支架或者取栓装置。