同房后尿道疼痛、小便刺痛，处理办法如下：
1.到医院进行尿常规化验检查，先明确有无尿路感染。如果存在尿路感染，可以口服喹诺酮类的抗生素，比如左氧氟沙星胶囊，或者头孢类的抗生素，比如头孢呋辛酯片等药物。用药需要严格遵照医嘱，并确保没有相关的药物过敏史。
2.需要进行性病的相关筛查，比如进行淋球菌的检查、支原体、衣原体检查等。如果确诊存在上述病原体，要针对性治疗。确诊淋球菌一般需要静脉使用头孢曲松钠进行治疗，用药时需要确保没有药物过敏史。如果存在支原体、衣原体感染，则可使用阿奇霉素等大环内酯类的药物，针对性治疗。
3.对症止痛治疗。如果疼痛比较剧烈，可以口服双氯芬酸钠缓释胶囊等药物缓解疼痛。但仅仅是对症治疗，还需要针对病因进行相关的治疗。