男性龟头沟溃疡最常见的原因是细菌感染。龟头沟即冠状沟，在日常生活中常有污垢以及细菌存在，在慢性摩擦的情况下很容易发生局部炎症。如果未能及时治疗则会发生龟头沟炎症加重，从而导致局部皮肤溃烂形成溃疡。
当男性发生龟头沟溃疡时，说明病情较为严重，一定要及时到泌尿外科就诊，提取溃疡表面炎性分泌物进行细菌培养检查，清除溃疡表面分泌物，选择敏感抗生素积极抗炎治疗。
在治疗期间是不能够进行性生活，因为此时进行性生活会导致女性发生妇科炎症。