大多数的肺癌能够通过支气管镜检查出来。而且通过支气管镜还可以做肺癌病灶的穿刺活检，从而明确肺癌的具体病理类型。但是也有一部分位于肺的周边部肺癌病变，不能通过支气管镜检查发现，也不能穿刺获取病理。
所以这些肺癌病变就需要通过胸部CT引导下的肺穿刺活检取得标本，通过穿刺标本的病理免疫组化结果，从而对肺部占位性病变进行病理学确诊。
除此之外，支气管镜的检查还可以对一些肺癌的病灶进行抗肿瘤治疗。例如镜下消融局部治疗癌病灶，使其缩小。