新生儿大便颜色发黑可以是正常现象，也可以是患病引起的症状。
早期新生儿在出生后几小时内排出的黏稠的黑绿色大便称为胎便，如果能够在生后及时按需哺乳，2~3天后就可以转为普通的大便。在新生儿期如果患有肠道出血，以及出血性疾病或者炎症感染，以及出生时咽下母亲的血液，或者乳头皲裂咽下的母血，都有可能导致大便颜色发黑。
新生儿出血症可以表现为消化道出血，也可以有脐带渗血、皮肤出现紫癜等情况，补充维生素K以后症状缓解很快。如果是炎症感染，患儿除了有消化道的出血，还可以出现发热、精神反应差，以及血常规和C-反应蛋白等各项指标的异常。
母血咽下综合征表现为出生以后喝奶前或者喝奶以后，呕吐红色或咖啡色黏液，会有咽下综合征的表现，经过洗胃等治疗症状缓解。如果哺乳姿势不正确出现乳头皲裂比较严重，患儿咽下母血也可以出现黑便。