盘状红斑狼疮的具体发病机制目前尚不清楚。可能和多种有害的因素有关，比如免疫损伤、家族遗传、病毒感染等。
免疫损伤被认为是发生盘状红斑狼疮的主要原因。免疫损伤会导致体内出现异常的免疫因子，这些异常的因子会沉积在全身的多个部位，诱发盘状红斑狼疮的症状。此病的发生还和遗传有关。盘状红斑狼疮的患者体内会存在多个染色体的异常，染色体异常就会导致此病发生遗传倾向。
体内的雌激素水平也和此病的发生有关，所以此病在育龄期妇女发病率相对较高。