腋下的小肉疙瘩去除方式有以下几种：
1.手术切除。外科手术治疗腋下的皮肤小肉疙瘩，可以在局部麻醉下行局部的梭形切除，将腋下皮肤表面的小肉疙瘩切掉后切口缝合换药，直至痊愈。
2.激光治疗。在皮肤科门诊利用激光的瞬间高能量使肉疙瘩组织坏死、气化，将腋下的小肉疙瘩去除后伤口处换药治疗。
3.在皮肤科门诊用液氮冷冻的方式治疗。极度低温使腋下小肉疙瘩细胞脱水后，组织坏死脱落，从而去掉腋下的小肉疙瘩。
当腋下有小肉疙瘩，建议去医院就诊。根据医生的建议选取合适的方式进行治疗。