牙龈肉发黑有可能来源于机体内血红蛋白内黑色素的沉着，体现在牙龈上出现黑色，但没有疼痛或肿胀感，对人体健康没有影响。
再有就是外源性物质导致，比如口内牙齿的金属烤瓷冠修复，慢性释放金属离子引起牙龈发黑、颜色变暗，长期可导致牙龈产生一条黑线，没法恢复正常。
还有极少数可能是发生金属铅中毒，铅进入血液循环后被吸收进入人体，会在牙龈上形成一条黑色的界线，需要查血诊断。
平时不注意口腔卫生，产生的龈下牙结石颜色相对较深，也可以透过较薄的牙龈透出黑色。