发热咳绿色脓痰时首先需要完善胸部X线或CT检查来判断肺部感染的程度，例如是否有支气管扩张合并感染、肺炎、肺脓肿等情况。同时需要行血常规、痰培养及其药敏试验等检测。
早期根据可能存在的感染致病菌予以相应的敏感的抗感染药物治疗，配合必要的祛痰等处理。对于有发热的患者要视情况予以退热处理。当然还要注意防治相应的并发症，部分严重的呼吸道感染患者可以继发脓毒血症，亦需要予以足疗程的抗感染治疗。
当有发热、咳绿色脓痰时，多提示患者有下呼吸道的感染，特别是细菌感染，要早期抗感染对症的治疗，此时抗感染疗程一定要足。