脑疝患者如果做腰穿，可能会导致颅腔以及脊髓腔之间压力明显增大，会引起脑疝进一步地加重而出现呼吸、心跳的停止。
对于瞳孔散大、脑疝患者不能行腰穿治疗，腰椎穿刺后会引起椎管内压力下降，同颅腔内形成明显的压力差，使脑组织移位更加明显，使脑疝导致的神经功能障碍进一步加重并危及生命。
因此，对于发生脑疝的病人，建议不要行腰穿治疗，可行脱水、利尿处理。但对于诊断及治疗颅内感染而必须要行腰穿治疗者，可先给予甘露醇快速静滴，再选择最细的腰穿针做腰椎穿刺，半堵管缓慢少量地放出脑脊液。