附睾炎属于炎症性疾病，一般治疗的原则是控制炎症，改善局部症状。首先需要到医院详细检查，包括阴囊彩超、尿常规、血常规等，区别是急性附睾炎还是慢性附睾炎，因为这两种附睾炎在治疗方案上有所区别。
对于急性附睾炎，一般主张使用敏感的抗生素，足程、足量抗感染治疗。治疗的药物可以口服，也可以静脉使用，最常用的药物包括头孢类抗生素、左氧氟沙星等。对于慢性附睾炎，病程一般较长，抗生素治疗效果一般不佳，所以口服药物改善局部症状为主，口服中药或中成药为主。
对于反复发作的附睾炎，经过保守治疗效果不佳的，没有生育要求的，可以考虑行附睾切除手术。