子宫纵隔是子宫的一种先天性畸形，在子宫腔内长了一个多余的隔，将原本应该是一个子宫腔分隔成两个不同的空间，子宫纵隔分为两大类，一类是完全性的纵隔，一类是不全纵隔。
正常情况下女性胎儿在发育的过程中，是两侧的副中肾管会合后形成一套完整的内生殖器。如果在发育的过程中因为某种因素，导致副中肾管汇合障碍，就会出现不同程度的生殖器畸形。
胎儿在母体内发育的过程中，两侧的副中肾管没有完全汇合，在宫腔内形成纵隔，是从子宫底到宫颈口之间形成一个隔，将宫腔分为两部分。如果是隔从宫底一直延伸到宫颈内口，这种情况叫完全性子宫纵隔，如果仅仅是一部分隔称为不全纵隔。