预防脑脓肿的方法如下：
一、患有中耳炎或者是鼻窦炎等耳源性疾病后，应及时地进行抗感染治疗，尤其是儿童患者，由于自身免疫力较低，感染扩散比较快，非常容易引起脑脓肿。因此，应当将鼻窦炎或者是中耳炎等疾病控制住，避免感染加重。
二、由于脑脓肿还可能为血源因素所导致，比如肺部感染。因此，在出现肺部感染后，应尽早地进行控制，避免血源性传播。
三、如果患有脑肿瘤疾病并且比较严重，要尽早地进行手术切除，避免脑肿瘤破裂后出现颅内感染对周围的脑组织造成压迫。