患者频繁发生尿道炎的危害可分为生理性危害和心理性危害两方面。
首先生理性危害方面。频繁发生尿道炎就需要频繁使用抗生素消炎治疗，会有很大几率导致患者出现抗生素耐药的情况，且抗生素多是通过肝脏或肾脏代谢的，长期频繁使用可能会导致肝肾功能不同程度的损害。另外，反复发生尿道炎会增加尿道结石的形成风险。
其次心理危害方面。患者发生尿道炎时常有排尿时疼痛的症状，导致患者生活质量下降，有些患者会出现焦虑等心理性疾病，还会影响到患者的性生活质量，影响夫妻感情，造成家庭不和睦。