由于肛瘘会肿痛流脓，引起营养物质丢失，所以会引起贫血。但早期的肛瘘一般是不会引起贫血的。
肛瘘可以分为瘘管、内口和外口，肛门局部容易残留细菌和粪便，通过外口直接经过瘘管进入到内口，导致内口受到感染。如果引流不畅，从而引发其他并发症。早期的肛瘘一般不会发生流血的症状，晚期的肛瘘是有可能发生流血的，刚开始流血量不会很多。但长时间地反复流血会导致体内丢失大量的营养元素，导致抵抗力下降而引起贫血的发生。使患者出现头晕眼花、食欲下降、全身乏力。
一旦形成肛瘘，要积极治疗，避免出现流血而导致贫血。