晚上头疼可能是原发性的头痛，比如偏头痛或者是紧张性头痛。如果经常饮酒、吸烟，精神心理压力过大，睡眠不足，在睡前饮用浓茶和咖啡等因素，都有可能会诱发原发性头痛，在晚上就会出现头痛的症状。
如果在晚上睡觉时没有关窗，导致身体着凉，有可能会诱发感冒，也会出现头痛。还伴有打喷嚏、流鼻涕等症状。
在夜间头痛还可能是高血压所引起，应当测量血压。在确诊后应当使用降压药物进行控制，防止血压过度增高。晚上头痛还有可能为鼻窦炎、颅内的占位性病变、脑膜炎等因素所引起。