慢性的尿路感染很难治得好，可能是因为使用的药物不对症，凭着经验使用药物，没有做中段的尿细菌培养加药敏，不知道什么样的病原体引起的尿路感染，也没有使用对症的药物，尿路感染容易成为慢性，而且很难治得好。
有时候患有糖尿病或者是其他疾病而导致机体的抵抗力下降，而它所引起的尿路感染，也很难治得好，这就需要针对基础疾病同时治疗，慢性的尿路感染就比较容易治得好。
有时候患有尿路梗阻或者是泌尿系的结石，同时合并有慢性的尿路感染，单纯治疗尿路感染而不解决梗阻或者是结石，尿路感染也不容易治得好。这就需要针对尿路梗阻以及结石进行对症的治疗，等这些疾病治好以后，尿路感染也容易治愈。