食管中段憩室如果引起了一些明显的临床症状，例如因为有食物残渣滞留而造成炎症，或者是发生了食管穿孔或食管出血，这种情况下需要及时采取手术治疗，手术主要就是将憩室部位切除。另外，部分患者可能会有营养不良的情况，患者可能需要静脉输液，从而缓解营养不良。
如果食管中段憩室目前并没有明显的症状，一般是不需要手术治疗。一般是选择服用药物治疗，例如吗丁啉、奥美拉唑等，这些药物可以促进胃动力，避免发生消化不良等情况。