习惯性腹泻会影响人体的消化吸收，导致营养不良、贫血、肠道菌群失调、胃肠功能紊乱等疾病。
严重者可导致胃肠道炎症感染、肠炎、溃疡性结肠炎、胃肠功能紊乱、脾肾阳虚等疾病。
因此，习惯性腹泻一定要查明病因，检查血、尿、便常规，必要时做便潜血、呼气试验、肿瘤标记物、胃肠镜以及相关的病理检查。确定排出恶性疾病后，明确病因，积极治疗，及时治愈疾病，切勿拖延消极对待，以免加重病情。
此外，习惯性腹泻对肠道和身体内癌症的生长也会有影响，所以必须先详细检查排出疾病，明确诊断，正规治疗。