流产肚子疼和痛经的感觉类似。流产所引起的肚子疼是子宫收缩所引起，而痛经时腹痛主要是由于在月经期前列腺素物质分泌增多引起的子宫收缩，肚子疼的感觉大致相同，但引起腹痛的原因有所不同。
由于流产所出现的肚子疼也会伴随流血的症状，所以如果女性出现流产时有可能被误认为是月经来潮。
另外，女性流产与痛经的鉴别在于有停经史，此时可以通过血液的人绒毛膜促性腺激素的检测，来了解女性是否怀孕，以及通过B超检查，了解宫内有无妊娠组织发育及了解其发育情况。