尿道口里面疼可能为尿道损伤、尿道结石、尿道感染等因素所引起。
如果在性生活时用力过大，或者是尿道部位遭受了外伤，可能会导致尿道黏膜出现损伤，就会引起尿道疼痛。如果尿道内存在结石，在结石移动时会对尿道造成损伤，也会引起尿道疼痛。一般还伴有排尿困难、尿流中断、尿频、尿急等症状。确诊后应及时地进行排石处理，避免引起其他并发症。
如果患有尿道炎，也容易导致尿道疼痛，一般还伴有尿道瘙痒、尿道口脓性分泌物增多等症状。在确诊后应进行抗炎治疗。