肉苁蓉有补肾阳、养精血、润肠通便的作用。
肉苁蓉可以归肾经，有明显的补肾阳的作用，可以用于治疗各种肾阳不足导致的临床症状，例如阳痿、不孕、腰膝酸软疼痛、筋骨无力。这种药物补肾阳的作用相对较为和缓，可以用于长期调理，并且对身体造成的副作用也相对较小，可以放心使用。肉苁蓉又有润肠通便的作用，可以缓解肠燥便秘的临床症状，在临床上往往和麻子仁一起使用。可以缓解因为肾气亏虚导致的大便不通、小便清长的临床症状。
在临床上，部分患者可能会因为肾阳亏虚影响到胃肠道，所以就会导致大肠的蠕动功能失调，就容易引起阳虚便秘。这类患者不仅会出现便秘的临床症状，而且会出现腰部冷痛或者全身怕冷的临床症状，这种情况下就可以选择性地使用肉苁蓉进行治疗，不仅可以温补肾阳，而且可以润肠通便。
在临床上，治疗效果相对较好，但是在用药的过程中应该中病即止。