目前研究认为，先天性脊柱裂的发生，主要是与遗传、感染及产前叶酸补充不足有关系。为了做到更好的预防，就是需要避免发生感染、补充充足的叶酸。
但是遗传因素这个没有办法去预防。 同时对于产前的患者可以做相关疾病的筛查，比如可以通过血清甲胚蛋白检测，以判断是否会发生脊柱裂，因为母体血清甲胚蛋白检测诊断脊柱裂的敏感度可以高达91%。同时可以辅助产前超声检查，90%~95%的脊柱裂可以经过产前超声检查检出。