三叉神经痛和牙痛的区别主要在发病机制、疼痛性质以及疼痛的部位有所区别。
三叉神经痛的发病机制目前尚不十分明确，有些学者认为可能与三叉神经受压以及三叉神经异常放电有关。而牙痛的发病机制主要与牙部的炎症感染以及肿瘤等病因相关。
三叉神经痛的临床症状主要表现为尖锐的刺痛、刀割样疼痛或者烧灼感。而牙痛的临床症状主要表现为持续性的钝痛。
此外，三叉神经痛的疼痛区域主要为上颌、下颌以及口唇部。而牙痛疼痛区域主要是位于牙龈。