使用激光并不一定能保证将扁平疣根除掉。因为扁平疣是感染人乳头瘤病毒HPV所引起的一种传染性皮肤病，即使使用激光除掉后，当再次感染人乳头瘤病毒时可以再次复发。
一般对于比较小且数量很少的扁平疣患者，不仅有一定的自愈倾向，患者也可以采用激光或者液氮冷冻的方式来进行治疗。
对于扁平疣数量较多的患者，临床上一般不建议做激光这类有创性的治疗。因为术后可能会留有瘢痕，此时建议患者口服或者外用一些维A酸类的药物或者外涂一些抗病毒的药膏等来进行治疗。