女性感染衣原体后可以导致体内出现炎症，衣原体可以导致女性患者的多个部位发生感染。
衣原体可以导致女性患者发生眼部的感染，主要表现为结膜炎，衣原体还可以导致女性患者出现呼吸道的感染，感染衣原体后患者可以出现发热、咳嗽的症状，病情严重的可以出现呼吸困难。
衣原体可以导致女性发生尿道炎，患者可以出现尿道刺激症状，衣原体还可以导致患者生殖系统的感染，患者可以发生阴道炎、子宫内膜炎等，患者还可以出现腹痛的症状。