龟头炎的确诊，主要通过临床表现，以及分泌物涂片培养检查、活检等方面综合判断。
比较常见的是浅表性龟头炎，患者可能会表现为龟头和包皮红肿。也可能出现龟头部刺痛，同时出现包皮污垢增多。但也有一些特异性的龟头炎，如淋球菌性的龟头炎，患者龟头处脓性分泌物比较多，甚至出现了溃疡情况，严重的还会伴随全身症状，如发热。
除此之外，需要进行涂片检查，明确龟头炎的具体类型，选择敏感的药物进行治疗，比如滴虫性龟头炎，则使用甲硝唑。念珠菌性的龟头炎，则可以选择氟康唑等药物。