半夜咳嗽咳醒要及时去呼吸内科就诊，此类咳嗽有可能是因咳嗽变异性哮喘引起。
首先需要拍胸部X线或CT检查，了解肺部有无相应的病变。咳嗽变异性哮喘需要完善呼出气一氧化氮测定检查，确诊后，则需要使用足疗程的吸入性糖皮质激素和止咳药物对症治疗。半夜咳嗽咳醒还可以见于部分肺部感染，特别是肺结核，其咳嗽程度多较为剧烈，此类肺部感染需要予以敏感的抗感染治疗。
此外，肺癌也可以引起晚间剧烈地咳嗽。肺癌患者则需要根据肺癌的病情予以相应的治疗，并配合镇咳处理。还有少数心力衰竭引起晚间睡觉咳嗽咳醒，此时要完善血BNP、心脏彩超等检查。心衰引起晚间咳嗽者要予以强心、利尿、扩血管等对症处理。
总之，当半夜咳嗽咳醒时，要针对病因予以对症治疗。