甲状腺乳头状癌是可以治疗的，而且多数的患者治疗效果是不错的。
通常在确诊甲状腺乳头状癌之后，首先要进行病情评估，确定是什么情况，以确定是保守观察，还是需要进一步治疗。对于症状并不典型，而且分化较好、肿瘤组织较小的，可以保守观察。对于已经存在转移或者肿瘤组织比较大的患者，是需要进行手术治疗的，手术通常进行甲状腺的部分切除或全切。如果有淋巴结转移，还要进行淋巴结的清扫。在此之后要进行后续的放射性碘-131治疗，进行清除甲状腺残存肿瘤组织或转移灶的治疗。
在这两项治疗之后，再进行长期的甲状腺激素的抑制TSH治疗。一方面补充缺乏的甲状腺激素，另一方面防止甲状腺乳头状癌的复发。经过这些治疗之后，大部分的患者的治疗效果是相当不错的。