第一点，炎症发生的部位不一样。结膜炎所发生的部位在球结膜、睑结膜以及穹隆部结膜，角膜炎所发生的炎症是在角膜上。
第二点，两者的充血也不一样。结膜炎的充血为结膜充血，越近穹隆部充血越明显。角膜炎的充血，为睫状充血或混合充血，越近角膜炎充血越厉害。
第三点，表现症状不一样。结膜炎的患者表现异物感烧灼样感分泌物增加，一般视力没有改变。角膜炎的患者，怕光流泪异物感明显，同时伴有视力的下降。
第四点，发病的病程也不一样。结膜炎的患者一般病程不长，因为结膜含有丰富的血管。痊愈的时间相对较短。角膜炎的病程相对较长，角膜为透明的组织，没有血管，营养的供给完全靠角膜炎周围的血管网和防水公里。