维生素B6缺乏症对儿童的影响比成人大，表现为皮炎、抽搐、周围神经炎和贫血。 皮肤损害包括唇炎、眼睛和嘴唇周围的皮脂溢。
幼儿可表现出发育迟缓和神经兴奋增加，年幼的婴儿可能会因频繁抽搐而患有精神和感觉发育障碍，同时免疫力也会下降，容易感染。
由于缺乏维生素B6，角质性唇炎和舌炎不容易与维生素B2和烟酸缺乏的人区分开，并且常常与其它B族维生素缺乏症并存，因此诊断比较困难。可以做一些实验室检查，例如24小时尿液中维生素b6含量的测定，也可以使用维生素b6进行实验治疗，均衡饮食可以防止维生素B6缺乏症的发生。