睾丸炎的类型不同，病因也不一样。
如果是急性非特异性睾丸炎，大多为继发性因素所引起，比如当男性患有膀胱炎、尿道炎等疾病以后，致病菌会传染至睾丸部位，从而引起睾丸发炎。也有少部分的睾丸炎可能是细菌通过血液循环传播至睾丸，导致单纯性的睾丸炎，但是这种情况概率较低。
如果在进行导尿操作或者是尿道器械检查时，没有严格进行无菌操作，也有可能会引起睾丸炎。如果是急性腮腺炎性睾丸炎，通常为腮腺炎经血液进入睾丸所导致，出现于青少年以及成年人群体中的概率较高。