胆囊底部腺肌症在临床上不算严重，通常属于一种良性病变，不伴有瘤性增生及恶性浸润，可通过手术切除予以治疗。单纯的胆囊底部腺肌症的症状不明显。如果合并有慢性胆囊炎或胆囊结石，则会出现上腹不适、肝区疼痛、消化不良等症状。
考虑到胆囊底部腺肌症在位置上的特殊性，需要与胆囊肿瘤进行鉴别，临床上首选B超对胆囊底部进行检查，可配合腹部CT进一步观察，如有条件者可进行病理活检以明确疾病性质。
如发现病灶增大或出现明显并发症，应及时进行手术切除。