扁桃体二度肥大，要根据具体的病情采取药物治疗或者手术治疗。
如果是短期内急性扁桃体感染引起的扁桃体二度肥大，可以采取药物保守治疗，应用足剂量的抗生素控制炎症、结合清咽利喉的药物。例如蓝芩口服液、蒲地蓝口服液，应用糖皮质激素抗水肿治疗，促进炎症消退，一般能得到明显的好转。对于扁桃体反复发炎，每年发作3~5次，即使是二度的肥大，也需要做手术切除。
如果炎症引起扁桃体二度肥大，出现打呼噜或者本身咽腔狭窄引起的二度肥大，有明显睡眠呼吸暂停，需要做手术切除。