感染尼帕病毒的患者会出现发热的症状。该病毒能够通过动物将人类传染，属于一种人畜共患的疾病，一旦发病之后，可引起严重的头痛、发热、肌肉酸痛、咽喉疼痛等症状。
还有一些患者会出现严重的呼吸道感染，可表现为喘憋、胸闷、呼吸困难等症状，随着病情的不断发展，甚至会引起呼吸衰竭。尼帕病毒还容易合并脑炎，这时可出现呕吐、恶心、头晕以及昏迷等症状。
虽然经过规范的治疗，症状可以有所好转，不过会因此而存在一些后遗症，比如癫痫反复发作，也会使性格出现一些变化，甚至容易导致智力下降，对生命产生比较大的威胁。