丙肝病毒属于RNA病毒，临床上根据核酸序列的同源性将其分成6种基因型，其中每一种基因型又分成多种不同的亚型，比如1A、1B、2A、2B、3A、3B等。
其中南方的丙肝患者可见于多种分型，而北方的主要分型为2A以及3型为主，其中基因3型相对其他分型病情发展的会更快一些。
治疗丙肝的目的主要在于最大可能的阻止病毒进行复制，减轻肝功能的损伤，防止病情发展演变为肝硬化甚至肝癌，延长患者的生命并且提高生存的质量。
在临床上丙肝的基因分型对于丙肝的抗病毒治疗有着一定帮助作用。