宫内孕和宫外孕的主要区别在于胚胎着床的位置不同。宫内孕胚胎着床在子宫内，是胚胎正常孕育的过程，能够正常生长发育，可以妊娠至足月分娩。宫外孕胚胎着床在子宫腔以外的部位，可能的部位有输卵管、卵巢、阔韧带、宫颈、肠系膜等部位，不能正常生长发育成婴儿，多以流产或大出血为结局。
宫内孕和宫外孕都是怀孕，在做尿妊娠实验的时候，宫内孕显示强阳性，宫外孕显示弱阳性。在做血HCG检查的时候，宫内孕血HCG值比较高，并且翻倍明显。宫外孕血HCG值比较低，并且升高缓慢，没有明显的翻倍现象。
做超声检查的时候，宫内孕可以在宫腔内看到妊娠囊或胎儿。宫外孕宫腔内空虚，可以在宫腔以外的部位发现妊娠囊或胎儿。