指甲有凹陷有可能是缺乏微量元素，比较常见的有缺铁、缺钙、缺锌。所以要及时到医院的皮肤科或者是营养科进行诊断，明确具体是哪一种营养素的缺乏，可以从饮食方面和药物方面，进行相关营养素的补充。
如果是缺铁，还有可能会形成缺铁性贫血，容易导致指甲有凹陷。指甲出现凹陷之后也被称作是反甲，需要及时进行血常规和铁蛋白的检测。可以在平时多补充富含铁元素的食物，补铁中还需要补充维生素C能够促进铁的吸收。
除此之外，缺钙、缺锌也容易导致指甲出现凹陷，还容易导致指甲上有横纹和竖纹，也需要针对性地进行营养素的补充。平时还需要注意指甲部位的清洁卫生，避免形成灰指甲的疾病。