目前临床上对于胆结石的治疗，包括排序治疗和手术切除治疗，但是具体的治疗方案需要结合相关的辅助检查和患者的实际病情。
对于部分较小的结石来说，理论上是可以通过服用鸡内金和熊去氧胆酸等药物进行溶石和排石治疗，但是临床发现溶石和排石只对胆固醇结石的效果较好，对于混合性结石和胆色素结石的治疗效果较差，而且在溶石过程中，有可能导致结石掉落至胆管，造成梗阻，使病情加重，因此目前临床治疗上，仍是以手术为主。
随着科技进步和医疗水平的提高，腹腔镜微创手术和内镜等无创手术，被广泛的运用到临床手术中，例如腹腔镜胆囊切除术和ERCP。