化脓性眼内炎的用药要根据患者具体病因、病症表现等情况来综合判断。
如果化脓性眼内炎为细菌感染所致，在疾病的初期，可考虑给予广谱抗生素药物控制感染，例如头孢菌素类，罗红霉素类，喹诺酮类等。后期可根据分泌物涂片和药敏试验结果，选择敏感性较高的药物治疗。
如果患者为真菌性感染致病，则应给予抗真菌药物治疗，例如两性霉素、氟康唑、咪唑类等，联合用药。部分病情较重的患者，可考虑局部眼周球旁注射或者玻璃体腔内注射的给药方式。