支原体感染是会复发。因支原体感染的部位不同，其复发率也有不一样。
对于支原体感染呼吸系统时，通过予以敏感的抗生素抗感染治疗，使其彻底的治愈，其复发率相对于较低。因为治愈以后的患者，其机体之内会产生相应的抗体，对支原体有一定的免疫力。当然如果未彻底的治愈，过早的停抗生素，其复发率也会增加。
此外，随着时间的延长，患者上述特有的免疫力会下降，在其因受凉、劳累、熬夜等原因下，当其再次受到支原体感染，可能会再次发生呼吸道的支原体感染。
对于泌尿道的支原体感染时，其复发率会高一些。此时患者一定要予以足疗抗感染治疗，同时保持健康的生活方式，才能降低其复发率。