子宫囊肿跟痛经可能会存在关系，比如比较大的囊肿，这样就会使月经血流出得相对比较缓慢，导致月经血淤积在宫腔之内，刺激而引起子宫收缩。
这样会导致痛经的症状，所以对于宫颈的囊肿相对比较大的情况下，尽快地考虑手术给予治疗。但是如果是相对比较小的囊肿，比如纳氏囊肿的情况下跟痛经没有关系。
另外，如果出现痛经就建议除了休息，除了保暖、加强营养、注意饮食之外，也要积极地检查，了解痛经是由什么原因所导致，根据病因再给予治疗，这样才能彻底缓解痛经的症状。并且也建议绝大部分子宫囊肿是由炎症引起，如果宫颈发生炎症性反应，要积极治疗。