食管结核可以通过电子胃镜直观地观察食管的病变及内镜下的活检病理学检查，并结合血沉、结核菌素试验等检查协助诊断。食管结核诊断还可以结合胸片、胸部CT、X线钡餐和诊断性的抗结核治疗进行诊断。
食管结核主要是由于结核分枝杆菌感染以及患者本身免疫力低下所导致出现的疾病，建议确诊以后采用抗结核药物进行治疗。
如果存在食管狭窄或者是其他并发症，也可能需要选择使用手术进行治疗。